PCV13后时期儿童侵袭性肺炎球菌病

虽然PCV13的应用使侵袭性肺炎球菌疾病的全球负担明显下降，但由于非疫苗血清型肺炎球菌引起的疾病发病率增加，侵袭性肺炎球菌疾病仍然具有重要临床价值。

目前已有几个国家的研究报道了血清型替代的事件，提出两种血清型替代机制：第一是新出现非疫苗型谱系非疫苗血清型分布增多，以部分填补疫苗型谱系减少腾出的生态位；第二是已有疫苗血清型谱系非疫苗血清型流行增加。

全球肺炎球菌测序(GPS)项目旨在通过定义全球肺炎球菌人群中的肺炎球菌谱系并试图捕捉谱系如何逃避疫苗，来指导设计PCV13以外肺炎球菌疾病的预防措施。作为GPS项目的一部分，通过分析个肺炎球菌基因组，确定了个全球肺炎球菌序列簇(GPSC)的高分辨率种群结构。

本次研究，我们旨在调查在6个国家引入PCV13后导致3岁以下儿童侵袭性肺炎球菌病的主要血清型及其相关谱系、疾病中血清型替代的机制，以及抗生素耐药性特征。

表1总结了六个经过筛选符合要求的国家的疫苗接种计划、补种计划和PCV覆盖量，以及收集菌株来源情况。

表1

引入PCV13后，由疫苗型肺炎球菌引起的侵袭性肺炎球菌疾病在以色列、南非和美国的发病率下降，在香港、马拉维和冈比亚的流行率显著下降（附录1）。在PCV13后，非疫苗型肺炎球菌占所有国家侵袭性肺炎球菌病病例的大部分，但香港除外，PCV13血清型3和19A仍占20例中的13例（65%）。PCV13后最流行的五种血清型因国家而异，但血清型5、12F、15B/C、19A、33F和35B/D在两个或更多国家中很常见。

图1和图2

表2展示了三个国家IPD中血清型替代的两种机制的个体贡献。

表2

表3列出了PCV13后引起非疫苗型侵袭性肺炎球菌疾病的十种最流行的国际谱系的合并发病率。在PCV13后，八种非疫苗型GPSC的发病率（GPSC3、59、55、、25、和，按合并发病率降序排列）或流行率（GPSC5）增加。在三种疫苗型GPSC（GPSC11、5和6）中，非疫苗血清型的发病率显著增加。其中，观察到GSPC5谱系在PCV13后在多个国家显著扩展；其他GPSC的扩展因国家而异（表3）。在十个最常见的GPSC中，三个（GPSC5、48和9）的青霉素不敏感率≥90%，四个（GPSC5、26、48和9）的菌株至少有64-%对两类抗生素不敏感（表3）。

表3

我们还观察到，在一个国家/地区引入PCV13后，表达相同血清型的谱系可能会发生不同的变化。相同的血清型可能与不同国家的不同主要谱系相关，这种差异可能是由初始细菌种群、宿主特征或国家之间抗生素选择压力的差异来解释的。

在南非，我们观察到在引入PCV期间，一个血清型15B/C谱系(GPSC25)取代了另一个血清型15B/C谱系(GPSC48)，称为克隆替换的事件。

附录1

PCV13的引入与对所有类别抗生素的不敏感率总体降低有关，但对氯霉素除外，在整个疫苗接种期间保持在5%左右，且在PCV13后观察到非疫苗型菌株对青霉素和红霉素的耐药性显著增加。

表4

本研究的一个限制是PCV13引入后的采样时间相对较短，这可以从一些国家，尤其是美国的前五种血清型中存在残留的PCV13血清型来表明。这种限制也阻碍了我们解释长期趋势的能力。鉴于这种情况，本研究所描述的变化是肺炎球菌重组以达到新平衡的早期指标。

总之，已有的侵袭性血清型谱系在全球流行增加是PCV13后时期血清型替代的重要机制，不同国家新出现的多种非疫苗血清型谱系的肺炎球菌可能与当地抗生素选择压力有关。在疫苗接种后时期，继续对增加的具有地域代表性的肺炎球菌种群动态进行基因组监测，将为未来的疫苗优化设计提供更多参考依据。

撰写：曾小静

校订：吴丽娟副主任技师

invasivepneumococcaldiseaseinthepost-PCV13eraaninternationalwhole-genomesequencingstudy.pdf

mmc1附录1.pdf

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